Er is inderdaad één film van Paul Thomas Anderson waarin Tom Cruise speelt, namelijk Magnolia (1999).
In deze film speelt Cruise de rol van Frank T.J. Mackey, een motivational speaker met een turbulente privéleven. De film is een ensembledrama met meerdere verhaallijnen die uiteindelijk met elkaar verweven worden. Ook al is Cruise geen hoofdpersonage, speelt zijn karakter een belangrijke rol in de plot.
Naast Magnolia heeft Paul Thomas Anderson tot nu toe niet met Tom Cruise samengewerkt.